崇祯十七年，北京城的天空被阴霾笼罩，仿佛预示着大明王朝摇摇欲坠的命运。
林羽本是个历史系的研究生，正熬夜研究明朝末年的史料，突然一阵天旋地转，再睁眼时，发现自己置身于一个昏暗狭小的房间，身上穿着一身破旧的明朝小吏服饰。桌上的烛火摇曳不定，墙壁上挂着几幅破旧的字画，散发着一股陈旧的气息。
林羽脑袋一阵剧痛，原主的记忆如潮水般涌来。他现在是顺天府大兴县的一个小小书吏，俸禄微薄，勉强维持生计。而最近，上头正催促着追缴赋税，可百姓们早已被连年的战事和灾荒折磨得苦不堪言，根本无力缴纳。若是完不成任务，自己恐怕乌纱帽不保，甚至还有牢狱之灾。这便是摆在他面前，让当代人瞬间共情的困境，就如同现代职场人面对完不成的业绩指标，压力如山。
林羽正心烦意乱时，突然听到一阵嘈杂的声音从窗外传来。他起身走到窗边，只见街道上一群官兵正追赶着一个衣衫褴褛的老人，老人手中紧紧抱着一个古朴的匣子，那匣子周身散发着奇异的微光，在这昏暗的天色下显得格外醒目，这便是那个神秘物品。林羽心中一动，觉得这匣子定不简单。
就在林羽犹豫要不要出去查看时，那老人竟慌不择路地朝他所在的院子跑来。官兵们紧随其后，很快将院子团团围住。林羽无奈，只得打开门。为首的官兵一脸凶相，瞪着林羽吼道：“你可见到一个抱着匣子的老头？”林羽心中盘算，若是如实相告，老人怕是凶多吉少，那神秘匣子也不知会落入何人之手。于是他佯装镇定地说道：“不曾见到。”官兵们不信，在院子里一番搜查，却一无所获。临走时，那为首的官兵恶狠狠地威胁道：“若是敢窝藏，你这小吏的命也别想要了！”
待官兵们离去，林羽在院子里四处寻找，终于在柴房的角落里发现了瑟瑟发抖的老人。老人见林羽并无恶意，缓缓打开匣子，里面竟是一颗散发着柔和光芒的丹药。老人颤抖着声音说道：“恩公，此乃长生丹，我偶然所得，一直秘藏，如今为报救命之恩，愿与恩公分享。”林羽半信半疑，但在这乱世之中，长生似乎也不失为一种保障。犹豫片刻后，他和老人一同服下了丹药。
刚服下丹药不久，林羽便感觉一股热流在体内涌动，全身充满了力量。可紧接着，他竟发现自己的伤口瞬间愈合，就连之前因劳累落下的病根也消失得无影无踪。还没等他细细体会这奇妙的变化，突然听到外面传来一阵马蹄声。
林羽小心翼翼地从门缝望去，只见一队身着黑色劲装的神秘人骑马而来，他们面色冷峻，眼神中透着一股肃杀之气。林羽心中暗叫不好，难道是为了这长生丹而来？神秘人在院子外稍作停留，便分散开来，开始在四周搜寻。这便是突然出现的紧急事件，让林羽意识到事情远比他想象的要复杂得多。
林羽和老人躲在柴房里，大气都不敢出。神秘人搜寻了一阵后，似乎并未发现什么异常，便骑马离去。林羽这才松了一口气，可当他低头时，却发现自己的手背上不知何时出现了一个奇怪的印记，像是一个古老的符文，散发着微弱的光芒。他心中疑惑，这印记又代表着什么？这便是暗示事情不简单的线索。
经过一番折腾，天色渐晚。林羽送走老人后，回到房间，疲惫地躺在床上。恍惚间，他进入了梦乡。在梦中，他看到了自己身处不同的时代，周围的人换了一批又一批，而自己却始终容颜未改。他这才惊觉，那丹药竟真的赋予了他永生的能力。
可还没等他从这惊喜中回过神来，第二天清晨，他刚到衙门，便被上司叫到了书房。上司一脸严肃地将一份公文扔到他面前，林羽拿起一看，顿时脸色煞白。公文上竟是关于他放走持有神秘匣子之人的弹劾，弹劾之人正是昨日那队神秘人中的一员。而更让他震惊的是，公文上所盖的印章，竟是他从未见过的，印章上的图案竟与他手背上的印记有几分相似。这解决了他是否获得永生的小问题，却又出现了更大的谜团，这些神秘人究竟是什么来历？与他手背上的印记又有何关联？他又该如何摆脱这困境？